ポータブル版最高！インストール版なんて要らなかったんや！とか言ってた人間ですが、ThunderbirdとDiscordとGIMPはインストール版にしました。理由はポータブル版だと不具合が出るか更新がしょっちゅうかかるかのどちらかです。
GIMPを構築します : ららら雑記帳

基本的にはポータブル版が楽でいいよねって点は変わりませんが、わりとちょくちょく使うソフトでどんどん改善されていくようなソフトウェアはアップデートを楽にするためにインストール版にしたほうが良いかもしれません。ThunderbirdとDiscordは常時起動状態でヘビーに使っているのでインストール版にしました。
ポータブル版だとうまくアップデートできませんよね。できてるのかな？

あと不具合。これ単純に使う上で致命的です。諦めてインストール版にしましょう。

以上です。まぁしょっちゅう無駄にクリーンインストールするような人以外はすべてインストール版を導入すれば問題ないしそっちのほうが良いと思います。