まぁ正直そこまで驚きはありません。
仮想通貨の入出金停止に関するご報告、及び弊社対応について｜テックビューロ株式会社のプレスリリース

ZaifがBTCの入出金を一時停止したという通知を見てま～た貧弱鯖かとか思っていましたが、まさかの流出とは・・・

そもそもいろいろとシステム関係で問題を起こしていたので、流出は時間の問題と思っていました。
他の取引所と比べて手数料は安いしオルトコインも比較的豊富だったのでセキュリティ等には多少目をつぶっていた人が多いのではないでしょうか。セキュリティ等を考えたらbitFlyerとかを選んだほうが良いと思います。

プレスリリースを見るに、被害はBTCとBCHとMONAみたいですね。BTCは自動売買でZaif内資産の半分程度、BCHとMONAは多少入っていました。
BTC自動売買ロボットシェアWebサービスQUOREAを使ってみた : ららら雑記帳

まぁ、補償されるみたいなのであまり深く考えていません。内部ではどうなっているか知りませんが、表面上はいつもどおり普通に資産はありますし取引もできるので・・・

セキュリティに関することはもっと詳しい他の方のTwitterでも見ていただければわかると思います。

おそらくそこまで提供サービスに変更はないのでしょうが、心配ではありますね。
手数料の急激な引き上げだけは勘弁してほしいです。